O programa de pós-graduação em Anestesiologia da FMUSP desenvolve projetos de pesquisa vinculados às linhas de pesquisa específicas, dentro da área de concentração Anestesiologia.
Os projetos de pesquisa são desenvolvidos nos centros cirúrgicos e Unidades de Terapia Intensiva do Complexo HC-FMUSP e também em laboratórios de pesquisa experimental da FMUSP e InCor.
Diversos projetos são desenvolvidos com verba de fomento, principalmente FAPESP, que resultam em produção científica relevante.